Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms