Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms