Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms