Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms