Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Upk1bQ9Z2C6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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