Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms