Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Olfr1032-203ENSMUST00000111589 1393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SrfQ9JM73 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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