Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Upk3aQ9JKX8 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Upk3aQ9JKX8 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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