Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Clstn1Q9EPL2 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Clstn1Q9EPL2 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Clstn1Q9EPL2 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Clstn1Q9EPL2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clstn1Q9EPL2 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms