Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Derl3Q9D8K3 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms