Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms