Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Usp27Q8CEG8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Usp27Q8CEG8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Usp27Q8CEG8 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp27Q8CEG8 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms