Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q8BGC1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q8BGC1 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8BGC1 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q8BGC1 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms