Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms