Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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