Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Sec31aQ3UPL0 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Sec31aQ3UPL0 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sec31aQ3UPL0 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sec31aQ3UPL0 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms