Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nhlrc4Q3UP44 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms