Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Sec24aQ3U2P1 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms