Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms