Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf6Q3TWW8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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