Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms