Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Gm37036-201ENSMUST00000192836 2506 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Gm9864-201ENSMUST00000090043 1656 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Gm13778-202ENSMUST00000146633 537 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Nf1Q04690 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Cass4-204ENSMUST00000228775 2629 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Nf1Q04690 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms