Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Top2aQ01320 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top2aQ01320 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms