Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Irx1P81068 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Irx1P81068 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Irx1P81068 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Irx1P81068 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irx1P81068 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irx1P81068 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms