Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms