Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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