Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CebpbP28033 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CebpbP28033 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CebpbP28033 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms