Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pou3f1P21952 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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