Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P18533 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P18533 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms