Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
P18530 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
P18530 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
P18530 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
P18530 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
P18530 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
P18530 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
P18530 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
P18530 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
P18530 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
P18530 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
P18530 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
P18530 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
P18530 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
P18530 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
P18530 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
P18530 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
P18530 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
P18530 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC9□□□□□ -0.97
P18530 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
P18530 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC9□□□□□ -0.97
P18530 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
P18530 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
P18530 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
P18530 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
P18530 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
P18530 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
P18530 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
P18530 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
P18530 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
P18530 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
P18530 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
P18530 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC9□□□□□ -0.97
P18530 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC9□□□□□ -0.97
P18530 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
P18530 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
P18530 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
P18530 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms