Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Prr13-202ENSMUST00000164688 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 1700102F20Rik-201ENSMUST00000203859 670 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms