Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm2035J3QP87 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms