Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vmn1r34G3XA52 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vmn1r34G3XA52 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms