Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms