Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms