Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms