Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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