Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 AC112680.1-201ENSMUST00000215435 1349 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 4930533K18Rik-203ENSMUST00000219192 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Olfr1283-203ENSMUST00000216637 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 AC133598.5-201ENSMUST00000224937 1517 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Gm3269-201ENSMUST00000166025 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Gm13651-201ENSMUST00000119086 1110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Olfr698-201ENSMUST00000074981 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Riok3Q9DBU3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 St7-201ENSMUST00000000674 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ighv2-2-201ENSMUST00000103443 352 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm11875-201ENSMUST00000118187 799 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riok3Q9DBU3 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms