Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pop5Q9DB28 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms