Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Lrba-204ENSMUST00000194759 9379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Cdkl1-201ENSMUST00000021377 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 2900060N12Rik-201ENSMUST00000221412 3721 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Thsd1-201ENSMUST00000069828 4422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms