Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snapc3Q9D2C9 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms