Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc47Q9D024 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc47Q9D024 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc47Q9D024 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc47Q9D024 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc47Q9D024 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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