Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gnpda2Q9CRC9 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 294.4 ms