Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms