Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ncapd2Q8K2Z4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ncapd2Q8K2Z4 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ncapd2Q8K2Z4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ncapd2Q8K2Z4 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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