Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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