Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Zbtb40Q6PCS8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Zbtb40Q6PCS8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Zbtb40Q6PCS8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Zbtb40Q6PCS8 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Zbtb40Q6PCS8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Zbtb40Q6PCS8 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Zbtb40Q6PCS8 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Zbtb40Q6PCS8 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Zbtb40Q6PCS8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Zbtb40Q6PCS8 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Zbtb40Q6PCS8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Zbtb40Q6PCS8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Zbtb40Q6PCS8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Zbtb40Q6PCS8 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Zbtb40Q6PCS8 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms