Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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Ccdc18Q640L5 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Ccdc18Q640L5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Ccdc18Q640L5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Ccdc18Q640L5 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Ccdc18Q640L5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc18Q640L5 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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