Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
VcanQ62059 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm12904-201ENSMUST00000117451 1399 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm15661-201ENSMUST00000117390 556 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm14276-201ENSMUST00000117941 720 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm12420-201ENSMUST00000119869 1048 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm12862-201ENSMUST00000150754 472 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm26913-201ENSMUST00000182391 732 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 AC160931.1-201ENSMUST00000223298 413 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Dhcr7-201ENSMUST00000073878 2815 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 1700034B16Rik-201ENSMUST00000180957 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 H2al1a-201ENSMUST00000188439 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm7424-201ENSMUST00000206919 902 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm40723-201ENSMUST00000219407 603 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm12362-201ENSMUST00000121986 342 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm21917-203ENSMUST00000180309 561 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 6430531B16Rik-205ENSMUST00000210254 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 AC140209.1-203ENSMUST00000227412 1524 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Rsrc1-209ENSMUST00000162693 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm40578-202ENSMUST00000221429 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 AC124400.2-201ENSMUST00000224939 253 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Vmn1r44-203ENSMUST00000226120 1772 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm12011-201ENSMUST00000119734 618 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm23497-201ENSMUST00000157738 130 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms