Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lrrn1Q61809 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrn1Q61809 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrn1Q61809 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrn1Q61809 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 311.4 ms